医学院历史悠久，其办学源头可追溯至1招生3年恩泽医局创办的本科医学班，前身是创建于1951年的浙江省台州卫生学校，2003年经浙江省人民政府正式批准，台州卫生学校并入台州学院，并以此为基础组建台州学院医学院。经过八十年的开拓进取，几代人共同写下了一部学院新生、成长、跨越的壮丽篇章。
医学院下设基础医学部、临床医学系、护理系、医学检验系、康复医学系五个教学机构。设有临床医学、护理学(含助产方向）、医学检验技术、康复治疗学四个本科专业。现有在校生1721名。学院50名专任教师中，现有教授、副教授24人。博士13人，硕士25人，师资队伍结构渐趋合理。
医学院牢固树立教学中心地位，进一步完善教学质量监控体系，加强教学过程管理，坚持“向课堂40分钟要质量”，并严格实行学院教学督导小组和各系部教学督导小组的听课评教工作。通过评教、意见反馈、集体备课，整改和提高教学质量。承担各级教学改革(研究)项目34项，其中省级教学改革项目6项，发表教学改革论文50余篇，获各级教学成果奖 12 项。
医学院一直重视科研工作，坚持科研强院、科研兴院，贯彻“以科研促教学、科研促教改，科研为地方经济、社会发展服务”的基本方针。2010-2016年，承担国家级科研课题 6 项，省部级课题22项，获科研总经费638.24万元，其中纵向经费359.5万元，共发表论文196篇, 其中SCI收录论文及一级期刊发表的论文共70余篇，获各级科研成果奖40余项，发明专利3项。
医学院实验教学中心下设一网一所五个实验平台，负责实施临床医学及护理学、医学检验技术、康复治疗学等专业的实验教学及医学院的科研、社会服务等工作。中心实验室建筑面积14538平方米，实验教学和科研用房6000多平方米，教学科研设备总值为2020万元，其中有研究级倒置荧光显微镜、荧光分光光度计、台式超速离心机、生物分子成像仪等10万元以上的大型设备20台（套）。
